17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4399 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  100 
 
 		 382 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  58.26 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  53 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  54.26 
 
 		 357 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  45.62 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  44.04 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  33.06 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  31.94 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  38.81 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  36.88 
 
 		 966 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.13 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  31.93 
 
 		 960 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  26.39 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  26.39 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  24.47 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  23.44 
 
 		 268 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>