36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2292 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  100 
 
 		 357 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  60.47 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  54.38 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  51.82 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  48.68 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  46.28 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  34.93 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  32.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  36.65 
 
 		 966 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  32.26 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  25 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  28.19 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.21 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  34.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.28 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.93 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  35.51 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  27.75 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  27.2 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  22.44 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  29.92 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  32.52 
 
 		 960 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  22.29 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  22.29 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  22.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.54 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  30.71 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  29.17 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  27.34 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.61 
 
 		 276 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  22.44 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  27.08 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.66 
 
 		 287 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  28.24 
 
 		 264 aa  42.7  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>