31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0944 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  100 
 
 
392 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  40.48 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  42.82 
 
 
382 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  42.72 
 
 
368 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  46.32 
 
 
357 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  41.03 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  29.97 
 
 
374 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.27 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  31.61 
 
 
396 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.02 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  32.72 
 
 
966 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.93 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  25.45 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  25 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  24.84 
 
 
266 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  32.37 
 
 
267 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.96 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  22.95 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  37.4 
 
 
960 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.35 
 
 
287 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  21.72 
 
 
273 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  24.35 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  31.48 
 
 
264 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  30.86 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.72 
 
 
264 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.67 
 
 
273 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  21.72 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30.08 
 
 
261 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>