13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 		 368 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  40.6 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  38.42 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  39.3 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  39.27 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  39 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  31.15 
 
 		 396 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  31.79 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  32.45 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  36.57 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  43.7 
 
 		 960 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1421  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.154534  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>