29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3110 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  100 
 
 
368 aa  705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  49.19 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  56.7 
 
 
357 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  50.76 
 
 
382 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  45.82 
 
 
436 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  41.83 
 
 
392 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  33.72 
 
 
374 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  32.58 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.99 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  24.81 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.15 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.56 
 
 
270 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  30.67 
 
 
966 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.35 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.71 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.85 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.04 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.05 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  22.35 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30.6 
 
 
261 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  26.6 
 
 
308 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  28.57 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  28.44 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  24.12 
 
 
283 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  27.67 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  28.57 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.21 
 
 
266 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  28.04 
 
 
279 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>