70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1046 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  31.5 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  30.71 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  24.41 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  28.76 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.69 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.78 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  24.86 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  24.14 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.91 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.91 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  30.69 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  30.69 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.53 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.97 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  28.78 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  22.84 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.01 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  20.36 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.2 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  22.15 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  24.78 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  24.81 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.81 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  22.88 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  28.71 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.53 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  26.19 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  22.12 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.37 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  23.95 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  23.95 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  22.64 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  26.62 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.71 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  21.72 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  19.59 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  20.17 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  21.47 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  22.12 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  18.63 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  25.47 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  29.91 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  19.7 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.28 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  31.08 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  31.08 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  23.12 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  21.64 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.51 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.58 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  23.6 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  23.72 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.3 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  21.83 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  23.53 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>