90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2319 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  290  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  85.14 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  83.78 
 
 		 196 aa  240  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  57.34 
 
 		 205 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  39.74 
 
 		 214 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  38.1 
 
 		 210 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  35.71 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  39.61 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  37.59 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  38.17 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  37.4 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  38.21 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  36.24 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  35.95 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  45.1 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  38.52 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  33.87 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.39 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  35.82 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  30.41 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 212 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  40 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.36 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.36 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  26.42 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.47 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  28.95 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  40.4 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  29.27 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  28.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  28.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  28.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  28.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  28.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  31.85 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 267 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  28.42 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  28.42 
 
 		 264 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.89 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.53 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.71 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  38.3 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 268 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  28.02 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  27.87 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  28.02 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  35.29 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  25.73 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.87 
 
 		 264 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  31.58 
 
 		 269 aa  50.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  40.24 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  28.65 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  35.63 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.99 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  27.5 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  32.79 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  35.64 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  28.07 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  27.17 
 
 		 265 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  31.15 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  33.67 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 		 269 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.41 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  31.15 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  29.55 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  34.13 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  26.02 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.97 
 
 		 244 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  32.77 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  30.28 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  23.21 
 
 		 332 aa  45.1  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.28 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.93 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 265 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 246 aa  43.9  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  37.78 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  21.95 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  37.78 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  37.78 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  21.74 
 
 		 267 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.93 
 
 		 255 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  47.69 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.41 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.23 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.5 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>