36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1539 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  100 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  98.48 
 
 		 197 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  68.88 
 
 		 197 aa  246  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  37.24 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  35.2 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  34.36 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  37.06 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  39.02 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  38.21 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  35.03 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  32.12 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  33.7 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  30.24 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  37.76 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  35.16 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  31.52 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  35.57 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  35.57 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  35.57 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  29.59 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.9 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  31.69 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  33.09 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  30.3 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  32.63 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  35.78 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  32.16 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.33 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 262 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  28.36 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  30.22 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  30 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.37 
 
 		 267 aa  41.2  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>