104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0502 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  100 
 
 		 201 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  50.25 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  56.5 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  59 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  39.39 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  36.73 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  36.32 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  36.26 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  35 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  34.18 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  34.69 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  41.82 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  34.54 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  37.44 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.89 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  33.83 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  31.43 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.73 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  36.02 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.44 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  28.71 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  41.82 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  39.59 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  40.57 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  29.7 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.72 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.7 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.06 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.7 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  25.68 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.34 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.54 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.32 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  23.48 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  29.69 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  31.16 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.43 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.15 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  29.15 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  35.2 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  32 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  34.75 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.83 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.83 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  27.42 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  28.23 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  32.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  32.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  32.43 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  24.51 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  32.43 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  21.88 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  34.34 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  32.43 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  22.27 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  31.47 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  31.47 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  31.47 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.51 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 770 aa  48.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.34 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.61 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  27.94 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.88 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  24.23 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  22.07 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  30.68 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  39.05 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  23.4 
 
 		 265 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  34.48 
 
 		 279 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.77 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  31.63 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  25.44 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  23.74 
 
 		 269 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  29.65 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.08 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  28.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  25.79 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25.79 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.56 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  27.52 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  25.15 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.35 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  23.74 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>