102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
209 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  40.7 
 
 
200 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  39.18 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  37.62 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  35.47 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  32.81 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  38 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  38 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  38 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  31.28 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  35 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  36.45 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  34.48 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.99 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  36.79 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  40.59 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  30.41 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  32.02 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  23.28 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.41 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.71 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  33.33 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  32 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  29.72 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.02 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  31.43 
 
 
211 aa  62  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  32.85 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  23.61 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.39 
 
 
810 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  32.52 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  27.55 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 
770 aa  58.9  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  34.48 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 
336 aa  57.8  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  31.16 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  28.21 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.45 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  22.65 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.36 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25.11 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.05 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 
314 aa  53.5  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.1 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  22.75 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  22.75 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  27.69 
 
 
332 aa  52.8  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  22.46 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  20.69 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  20.69 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  29.08 
 
 
202 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.61 
 
 
264 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  22.82 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  28.57 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  21.85 
 
 
268 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  22.75 
 
 
264 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  29 
 
 
264 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  22.88 
 
 
262 aa  48.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  22.11 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  21.65 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  21.65 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.64 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  30.3 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  32.5 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.28 
 
 
269 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  30.53 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  24.26 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  28.87 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  33.67 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  22.65 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  33.67 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  27.27 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  28.72 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.37 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  23.85 
 
 
438 aa  45.4  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  25.99 
 
 
257 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  22.08 
 
 
263 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.78 
 
 
272 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.44 
 
 
244 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  25 
 
 
259 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  23.32 
 
 
265 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  40.68 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  27.56 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  27.69 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  22.55 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  31.66 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  35.29 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  26.79 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  29.08 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>