76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0158 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  100 
 
 		 249 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  47.53 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2731  cobalt transport protein  46.39 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3441  cobalt transport protein  45.38 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3493  cobalt transport protein  45.38 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.210593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3430  cobalt transport protein  45.38 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12348  hypothetical protein  46.25 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.69 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  31.1 
 
 		 944 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.9 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.62 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.76 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.62 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.11 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  24.23 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.77 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.51 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.77 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.07 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.07 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.65 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.14 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.79 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.17 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  25.84 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  29.47 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  27.07 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.72 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  25 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  28.76 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.89 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  27.08 
 
 		 438 aa  55.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.77 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  30.62 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.69 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  28.19 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.9 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  23.35 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  21.51 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.11 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  31.1 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  27.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.96 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.71 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  31.07 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  28.85 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.17 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  30.12 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  32.79 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  30.12 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  30.12 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  29.36 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  29.6 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  24.9 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  20.57 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  30.99 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  25.53 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  18.42 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.36 
 
 		 332 aa  42.4  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  22.65 
 
 		 265 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>