72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12348 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12348  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  541  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  64.54 
 
 
282 aa  351  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3441  cobalt transport protein  68.66 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3430  cobalt transport protein  68.28 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3493  cobalt transport protein  68.28 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.210593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2731  cobalt transport protein  65.93 
 
 
282 aa  318  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  46.64 
 
 
249 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  32.26 
 
 
944 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.87 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  28.32 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  28.4 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.16 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.82 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.85 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  27.43 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.19 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.19 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25.19 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.67 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.55 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  23.61 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.52 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  22.71 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  25.1 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  26.24 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  26.24 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  25.2 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.74 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  22.97 
 
 
438 aa  54.3  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  25.2 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  21.37 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  25.21 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  23.42 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  28.36 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  20.35 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  27.15 
 
 
200 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  28.28 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  28.28 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  19.44 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  27.05 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.73 
 
 
810 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  30.51 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  31.79 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  28.08 
 
 
291 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.84 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  29.68 
 
 
200 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  25.87 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  24.21 
 
 
262 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.4 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  26.19 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.21 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  21.81 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  27.11 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  26.91 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  26.91 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  26.91 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  31.4 
 
 
205 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.16 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  24.06 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>