35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1157 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  100 
 
 
223 aa  430  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  33.17 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  33.82 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  37.13 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  31.98 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.64 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  34.83 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  31.82 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  28.93 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  36.63 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  30.29 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  33.5 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  27.78 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  32 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  23.7 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  27.88 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  33.16 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  33.16 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  33.16 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  27.41 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.33 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.33 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  31.25 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  30.19 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  41.89 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  29 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.22 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  34.96 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.43 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  25.22 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  28.36 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  23.89 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.21 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  28.33 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.44 
 
 
267 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>