177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0352 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  43.16 
 
 		 810 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  33.08 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  33.97 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  33.97 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  33.85 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  33.85 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 770 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  33.97 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  33.07 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  33.61 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  31.95 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  31.95 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  32.53 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  32.31 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  32.69 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  32.3 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  32.53 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  34.48 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  33.05 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  32.22 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  33.2 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  33.05 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.07 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  33.46 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.79 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  27.52 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  33.98 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  31.09 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  35.86 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.01 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.99 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  31.78 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.5 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.23 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.51 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  34.55 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  28.45 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 		 336 aa  97.4  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.97 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  29.96 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.34 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.02 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  27.96 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  24.32 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  29.18 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  25.42 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  27.62 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  29.6 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.67 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  25.87 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  24.81 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  25.29 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  26.69 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  26.69 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  25.86 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  25.79 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  23.75 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  26.54 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  28.03 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  26.91 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  28.1 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.45 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  27.8 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  29.88 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.52 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.45 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.52 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  24.43 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.23 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  31.2 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  29.66 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  26.12 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  30.4 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  25.56 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  23.77 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  28.19 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  37.97 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  26.38 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>