88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1637 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1637  cobalt transport protein  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.125207  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.53 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.45 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.23 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1452  cobalt transport protein  26.3 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0864828  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.7 
 
 
246 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.18 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1928  cobalt transport protein  24.81 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.74 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0034  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.09 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0846524  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.43 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  25 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.25 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.09 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.02 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.11 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.11 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  28.46 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.37 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  27.33 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.95 
 
 
265 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.41 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.99 
 
 
313 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.87 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.74 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  24.46 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.56 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1008  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.09 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0328725  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.94 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1937  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.6 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1769  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.21 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.344315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.57 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.78 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.05 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  20.97 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  27.66 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.52 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0088  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.79 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.69 
 
 
271 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  30.19 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1754  cobalt transport protein  33.33 
 
 
216 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0819489  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  26.23 
 
 
254 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0694  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.21 
 
 
255 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0473101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.72 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1118  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.95 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.87 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.62 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.81 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115944  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  32.94 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  31.43 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.27 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.19 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.89 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  22.75 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  28.11 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.44 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.15 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.01 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.67 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0994  cobalt ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.53 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.23 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  29.49 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.89 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.95 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.87 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1779  cobalt transport protein  28.57 
 
 
216 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.719291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.27 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  26.47 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.87 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.33 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  25.93 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.91 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  24.37 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.6 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5177  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.61 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.85 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.18 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0888  cobalt transport protein  21.5 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  23.51 
 
 
310 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.88 
 
 
259 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  24.44 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  28.26 
 
 
252 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  24.44 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  24.26 
 
 
268 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.3 
 
 
266 aa  42  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>