43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1034 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1034  cobalt transport protein  100 
 
 		 319 aa  619  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.876495  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2688  cobalt transport protein  58.31 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0847  cobalt transport protein  31.33 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  23.44 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  25.77 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  21.63 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.46 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  25.27 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.44 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  21.83 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  23.27 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  21.94 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.17 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.17 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25.2 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  25.97 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  30.08 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  25.29 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.04 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  25.35 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  24.02 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  23.4 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  24.1 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.46 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  21.11 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.09 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  27.1 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  29.56 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  26.09 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  22.7 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  25.76 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  28.05 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  28.47 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  23.51 
 
 		 257 aa  42.7  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>