70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0847 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0847  cobalt transport protein  100 
 
 
302 aa  596  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2688  cobalt transport protein  35.17 
 
 
321 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1034  cobalt transport protein  31.33 
 
 
319 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.876495  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.98 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.32 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  29.2 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  23.58 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25.43 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  25.7 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  22.13 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.74 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.75 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  24.03 
 
 
262 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  23.78 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  24.19 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  26.62 
 
 
267 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.4 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  23.02 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  24.63 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  22.78 
 
 
270 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  23.77 
 
 
263 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  23.77 
 
 
263 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.15 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  22.14 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.28 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  24.9 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  27.39 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.78 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  22.81 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  27.14 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  26.12 
 
 
264 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  22.03 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  22.03 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  30.17 
 
 
216 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.1 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  26.97 
 
 
279 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  23.2 
 
 
268 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  23.2 
 
 
268 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  21.25 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  21.28 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  21.46 
 
 
257 aa  46.2  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  23.13 
 
 
266 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  23.48 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  23.41 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  21.72 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  22.22 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.52 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  25.74 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  25.91 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  19.18 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  22.4 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  21.32 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.73 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  24.67 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.91 
 
 
266 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  21.32 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  28.57 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.71 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  23.85 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>