221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0749 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0749  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  27.42 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0184  HAD family hydrolase  29.21 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  30 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.73 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3640  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.12 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  27.75 
 
 
267 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.81 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.86 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  25.25 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.63 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  26.9 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  24.58 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  26.6 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.32 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.95 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  24.86 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
232 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
253 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  22.41 
 
 
232 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  24.51 
 
 
200 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.21 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.44 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  23.62 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  24.56 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  23.79 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  25.81 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.62 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  29.14 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.18 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  21.84 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.5 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  25.82 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  25.76 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  26.37 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 
253 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  27.27 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  20.63 
 
 
188 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.67 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.29 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  24.73 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.55 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  23.71 
 
 
230 aa  48.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.44 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  24.5 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  20.98 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  23.94 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  23.94 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  24.49 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  31.58 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  21.13 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  21.21 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  20.79 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.2 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  27.17 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24 
 
 
224 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>