245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0502 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0502  sodium-dependent transporter, putative  100 
 
 		 490 aa  978    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0835016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1908  sodium:neurotransmitter symporter  40.08 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0707768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0722  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000150418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  30.67 
 
 		 493 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  30.67 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  29.76 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  28.24 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  28.87 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  32.4 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  32.28 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  32.08 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  28.98 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  28.76 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.5 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  28.6 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  27.91 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  28.38 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  31.53 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  28.35 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  28.51 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  28.51 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  30.32 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  28.67 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  32.89 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  28.16 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  28.86 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  31.32 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  30.77 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  31.58 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  31.04 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  28.46 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  27.9 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  27.94 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  28.12 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  30.52 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  28.68 
 
 		 524 aa  153  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  32.22 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  27.64 
 
 		 505 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  29.07 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  27.27 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  28.49 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  28.2 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  28.2 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  28.2 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  28.2 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  28.2 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  28.49 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  28.37 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  28.2 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  26.77 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  26.39 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  28.07 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  27.91 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  27.91 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  28.53 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  29.5 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  27.1 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  27.98 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  29.85 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  26.08 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  29.31 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  26.84 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  25.65 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  28.82 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  27.1 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  28.61 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  28.76 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  27.1 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  27.55 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  26.45 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  30.42 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1598  sodium:neurotransmitter symporter  26.93 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  28.5 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  26.87 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  27.78 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  28.24 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  29.81 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  28.26 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  26.14 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  24.95 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  27.9 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  29.16 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  28.72 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  27.88 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  27.42 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  27.88 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14351  SNF family Na(+)-dependent transporter  29 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0684124  hitchhiker  0.00560218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  29.76 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  27.42 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  27.98 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  24.23 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  27.85 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  28.61 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  29.73 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  27.46 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  26.83 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  28.72 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>