64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12308 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  64.16 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  62.95 
 
 
232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  62.78 
 
 
232 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  62.78 
 
 
232 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  32.82 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  32.82 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  30.26 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  29.84 
 
 
208 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  32.51 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
206 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  31.07 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  29.53 
 
 
205 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  31.98 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  32.82 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  32 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  31 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  29.84 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  30.96 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  28.21 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  28.8 
 
 
203 aa  82  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  29.56 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  30.69 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  31.66 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  32.64 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  29.81 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  29.44 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  29.08 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  27.41 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  30.35 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  28.8 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  29.29 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  31.98 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  29.06 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  25 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1507  hypothetical protein  27.54 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  29.94 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0098  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
231 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000192012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  22.35 
 
 
197 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3881  DsbA oxidoreductase  51.22 
 
 
69 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  20.88 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 
200 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>