52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2192 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  65.99 
 
 		 203 aa  259  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  61.88 
 
 		 206 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  63.82 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  60.82 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  62.89 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  59.61 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  61.08 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  56.57 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  59.41 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  53.08 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  55.44 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  53.69 
 
 		 204 aa  207  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  52.43 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  52.28 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  53.61 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  54.08 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  51.02 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  51.52 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  50.75 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  50.75 
 
 		 206 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  50.75 
 
 		 206 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  49.01 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  49.27 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  51.55 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  50.72 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  49.23 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  50.24 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  49.75 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  50.52 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  49.74 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  49.48 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  49.53 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  52.06 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.5 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  49.75 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  44.83 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  49.49 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  44.22 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  43.75 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  38.86 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.26 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  35.38 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  37.06 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  30.62 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.35 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>