52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1383 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  58.25 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  59.11 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  58.79 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  56.8 
 
 		 207 aa  239  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  57.43 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  59.09 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  50.95 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  53.96 
 
 		 204 aa  231  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  57.44 
 
 		 214 aa  231  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  53 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  54.23 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  55.45 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  52.97 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  62.44 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  53.43 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  52.48 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  52.79 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  50.77 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  51.21 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  52.76 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  51.79 
 
 		 219 aa  214  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  54.5 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  51.78 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  49.48 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  52.76 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  50.75 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  51.79 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  51.02 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  47.78 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  46.3 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  51.79 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  45.37 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  44.72 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  45.5 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  44 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  39 
 
 		 243 aa  137  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  38.35 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  37.67 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  38.42 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  35.75 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.84 
 
 		 230 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  27.8 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  29.76 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>