51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7335 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  71.56 
 
 
204 aa  301  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  73.23 
 
 
205 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  71.72 
 
 
203 aa  288  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  65.7 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  66.16 
 
 
204 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  63.64 
 
 
219 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  61.46 
 
 
207 aa  270  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  62.93 
 
 
207 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  64.5 
 
 
203 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  64.42 
 
 
212 aa  262  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  59.52 
 
 
221 aa  259  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  63.41 
 
 
207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  61.76 
 
 
206 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  63.41 
 
 
206 aa  255  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  61.95 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  61.95 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  61.95 
 
 
207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  61.46 
 
 
206 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  63.32 
 
 
203 aa  250  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  61.4 
 
 
214 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  61.69 
 
 
204 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  60 
 
 
206 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  60 
 
 
220 aa  245  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  59.9 
 
 
204 aa  245  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  58.94 
 
 
216 aa  241  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  65.99 
 
 
211 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  60.1 
 
 
204 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  58.29 
 
 
207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  50.95 
 
 
208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  55.94 
 
 
207 aa  224  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  56.57 
 
 
205 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  56.12 
 
 
200 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  55.29 
 
 
209 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  51.5 
 
 
201 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  52.55 
 
 
205 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  54.72 
 
 
212 aa  201  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  47.6 
 
 
206 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  50.26 
 
 
206 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  40.97 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  42.93 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.74 
 
 
244 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  39.13 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  34.52 
 
 
202 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  31.38 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.69 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>