51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1143 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  74.5 
 
 		 207 aa  320  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  73.1 
 
 		 207 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  66.17 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  66.17 
 
 		 206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  66.17 
 
 		 206 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  66.17 
 
 		 206 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  63.86 
 
 		 221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  65.02 
 
 		 207 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  65.84 
 
 		 220 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  66.15 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  64.8 
 
 		 206 aa  267  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  58.33 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  60.61 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  58.13 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  60.3 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  60.3 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  63.21 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  60.82 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  60.1 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  58.38 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  56.84 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  55.67 
 
 		 203 aa  227  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  58.55 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  56.61 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  58.59 
 
 		 214 aa  222  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  53.43 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  54.36 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  55.22 
 
 		 203 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  57.45 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  56.54 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  53.54 
 
 		 212 aa  204  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  51.53 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  54.92 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  50.49 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  49.74 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  46.77 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  46.77 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  47.15 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  40.31 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  37.56 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  38.16 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  38.5 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  36.02 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  32.82 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.47 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  32.93 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>