51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4056 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  86.41 
 
 
206 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  83.98 
 
 
206 aa  363  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  84.47 
 
 
206 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  83.98 
 
 
206 aa  363  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  76.1 
 
 
207 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  74.51 
 
 
207 aa  311  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  70.65 
 
 
221 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  67.01 
 
 
207 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  71.14 
 
 
200 aa  276  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  63.55 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  64.8 
 
 
204 aa  267  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  61.39 
 
 
204 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  62.81 
 
 
204 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  64.71 
 
 
203 aa  257  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  61.81 
 
 
205 aa  249  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  60 
 
 
217 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  59.51 
 
 
207 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  63.41 
 
 
214 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  57.79 
 
 
214 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  59.09 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  60.19 
 
 
204 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  57.35 
 
 
207 aa  237  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  55 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  57.64 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  55.67 
 
 
203 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  55.45 
 
 
207 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  56.65 
 
 
203 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  55.78 
 
 
219 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  57.56 
 
 
211 aa  224  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  52.43 
 
 
206 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  51.22 
 
 
205 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  54.38 
 
 
216 aa  214  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  51.64 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  55.05 
 
 
212 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  50.7 
 
 
209 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.82 
 
 
206 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  50.72 
 
 
205 aa  187  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  46.7 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  39.81 
 
 
244 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  39.9 
 
 
241 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  39.51 
 
 
243 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  38.27 
 
 
197 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  36.28 
 
 
246 aa  118  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.5 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  32.51 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
232 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>