51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1399 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  73.91 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  76.21 
 
 		 206 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  76.21 
 
 		 206 aa  321  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  76.21 
 
 		 206 aa  321  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  76.47 
 
 		 206 aa  318  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  74.51 
 
 		 206 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  72.14 
 
 		 221 aa  307  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  77 
 
 		 200 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  67.15 
 
 		 207 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  62.93 
 
 		 217 aa  270  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  65.02 
 
 		 204 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  64.25 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  63.29 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  65.05 
 
 		 203 aa  264  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  61.35 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  61.76 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  61.22 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  61.03 
 
 		 203 aa  251  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  60.91 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  60.58 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  59.11 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  61.19 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  60.4 
 
 		 207 aa  244  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  62.12 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  60 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  58.71 
 
 		 203 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  59.7 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  55.45 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  53.62 
 
 		 205 aa  228  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  55.39 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  60.71 
 
 		 211 aa  220  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  54.81 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  51.18 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  57.65 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  53.61 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  51.18 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.82 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  45.64 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  37.44 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  41.15 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  36.92 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  35.94 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  35.68 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  30.69 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  33.13 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  32.31 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>