51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0835 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  36.14 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  36.18 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  36.22 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  35.53 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  33.17 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  35.5 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  31.34 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  33.5 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  32.99 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  33.02 
 
 		 244 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  31.5 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  31.98 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  31.82 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  32.67 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  31.98 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  32.39 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  32.47 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  29.85 
 
 		 221 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  29.65 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  31.84 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  29.44 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  31.66 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  32.32 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  27.8 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  30.24 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.44 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  30.62 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  34.47 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  30.05 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  33.75 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>