51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3412 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  70.3 
 
 
204 aa  289  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  65.99 
 
 
217 aa  261  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  65.83 
 
 
203 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  67.14 
 
 
214 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  64.56 
 
 
207 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  65.82 
 
 
204 aa  254  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  63.11 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  62.69 
 
 
203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  60.3 
 
 
219 aa  248  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  62.69 
 
 
205 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  62.89 
 
 
205 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  60.29 
 
 
212 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  57.56 
 
 
206 aa  240  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  59.02 
 
 
206 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  58.33 
 
 
206 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  58.33 
 
 
206 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  57.84 
 
 
206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 
207 aa  236  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  55.83 
 
 
221 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  53.92 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  58.97 
 
 
204 aa  231  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  56.44 
 
 
207 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  57.14 
 
 
214 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  58.97 
 
 
203 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  55.61 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  55.84 
 
 
207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  51.79 
 
 
208 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  54.92 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  55.98 
 
 
209 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  51.42 
 
 
220 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  53.33 
 
 
200 aa  207  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  53.4 
 
 
216 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  49.51 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  51.79 
 
 
205 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  50.72 
 
 
212 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  49.5 
 
 
206 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  48.21 
 
 
201 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  52.58 
 
 
206 aa  174  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  47.64 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  40.09 
 
 
243 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  38.83 
 
 
244 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  35.58 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  37.91 
 
 
246 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.32 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  28.65 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>