51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5304 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  63.64 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  64.8 
 
 		 204 aa  271  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  65.02 
 
 		 207 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  62.76 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  65.17 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  62.05 
 
 		 203 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  61.81 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  60.51 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  57.14 
 
 		 214 aa  237  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  58.46 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  60.82 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  52.83 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  55.45 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  57 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  55.78 
 
 		 206 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  56.46 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  55.61 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  55.78 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  60.3 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  55.56 
 
 		 212 aa  221  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  53.77 
 
 		 204 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  53.81 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  54.26 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  57.45 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  51.79 
 
 		 208 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  54.87 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  53.33 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  52.09 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  49.23 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  49.74 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  48.21 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  50.96 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.5 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  46.43 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  46.8 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  42.93 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  36.62 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  34.27 
 
 		 244 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  33.65 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  33.65 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  33.67 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  31.48 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  28.8 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>