51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3891 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  88.89 
 
 
207 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  71.29 
 
 
214 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  65.17 
 
 
219 aa  258  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  63.41 
 
 
217 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  61.84 
 
 
204 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  61.19 
 
 
207 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  60.19 
 
 
206 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  60.19 
 
 
206 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  62 
 
 
203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  59.72 
 
 
206 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  60.29 
 
 
203 aa  241  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  59.24 
 
 
206 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  60.2 
 
 
204 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  57.28 
 
 
207 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  63.11 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  54.76 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  58.71 
 
 
205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  57.36 
 
 
207 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  56.5 
 
 
221 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  54.5 
 
 
206 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  55.45 
 
 
206 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  59.61 
 
 
205 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  58.55 
 
 
204 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  54.46 
 
 
214 aa  224  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  55.45 
 
 
204 aa  224  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  56 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  52.79 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  51.21 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  55.07 
 
 
200 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  50.69 
 
 
216 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  52.24 
 
 
204 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  52.5 
 
 
203 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  53.96 
 
 
209 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  48.53 
 
 
201 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  49.51 
 
 
206 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  45.63 
 
 
205 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  50.25 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  45.89 
 
 
206 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  45.36 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  36.54 
 
 
244 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  35.64 
 
 
243 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.76 
 
 
241 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  38.39 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  36.18 
 
 
202 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  32.35 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.08 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>