51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2082 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  68.62 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  64.32 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  64.17 
 
 
246 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  43.26 
 
 
214 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  37.9 
 
 
204 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  39.73 
 
 
205 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  41.55 
 
 
204 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  37.09 
 
 
203 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  39.72 
 
 
221 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 
206 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 
206 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 
206 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  41.26 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  38.03 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  39.81 
 
 
206 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  39.91 
 
 
206 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  38.16 
 
 
207 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  38.43 
 
 
203 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  38.35 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  38.16 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  36.94 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  35.98 
 
 
205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  36.56 
 
 
203 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  38.03 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  38.83 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  37.2 
 
 
212 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 
201 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  36.54 
 
 
207 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  36.49 
 
 
206 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
200 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  37.84 
 
 
209 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
204 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  37.27 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  34.3 
 
 
206 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  37.09 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  35.58 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  32.85 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  34.27 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  34.6 
 
 
197 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  33.49 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  33.02 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  31.07 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
232 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 
232 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  29.41 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>