51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1801 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  55.67 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  49.74 
 
 
206 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  44.17 
 
 
212 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  45.23 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  45.31 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  45.41 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  45.88 
 
 
207 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  44.16 
 
 
205 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 
217 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  43 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  42.71 
 
 
207 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  45.36 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  43.52 
 
 
204 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  41.41 
 
 
221 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  44.5 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 
207 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  43.75 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  42.13 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  47.64 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  41.05 
 
 
204 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  42.93 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
206 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
206 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  40.1 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
206 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  39.27 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  38.66 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  39.47 
 
 
203 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  38.27 
 
 
206 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  41.15 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  37.06 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  35.75 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  36.98 
 
 
201 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  37.62 
 
 
216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  37.13 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  38.92 
 
 
212 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
200 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  34.6 
 
 
244 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  37.07 
 
 
246 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  31.9 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  30.05 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  31.98 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  33.15 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>