51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4895 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  64.32 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  62.98 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  61.67 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  42.53 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  40.58 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  40.95 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  38.65 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  37.68 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  39.9 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  39.25 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 206 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 206 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 206 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  39 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  38.76 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  39.51 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  36.24 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  37.68 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  38.5 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  35.84 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  36.5 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  40.09 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  36.95 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  36.14 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  37.33 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  37.68 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  38.86 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  37.25 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  39.44 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  34.6 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  37.13 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  34.62 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  33 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.67 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  31.66 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  28.5 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>