52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0229 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  60.3 
 
 
204 aa  246  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  60.71 
 
 
207 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  62.05 
 
 
207 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  59.49 
 
 
221 aa  231  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  57.65 
 
 
207 aa  222  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  55 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  55.33 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 
206 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 
206 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  54.46 
 
 
205 aa  218  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  54.72 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  55.05 
 
 
206 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  54.5 
 
 
214 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  54.31 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  53.33 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  54.04 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  54.12 
 
 
203 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  55.79 
 
 
201 aa  208  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  54.12 
 
 
205 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  52.31 
 
 
220 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  52 
 
 
204 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  56.41 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  51.79 
 
 
208 aa  197  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  51.79 
 
 
203 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  50.24 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  50.72 
 
 
211 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  51.5 
 
 
207 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  50.25 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  50.25 
 
 
204 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  45.37 
 
 
206 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  49.75 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  49.49 
 
 
205 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  46.8 
 
 
219 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  45.33 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  45.15 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  43.63 
 
 
212 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  40.78 
 
 
243 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.2 
 
 
244 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.27 
 
 
241 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  39.52 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  38.92 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  31.98 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  32.81 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  28.48 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>