51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7324 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  63.9 
 
 
204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  62.8 
 
 
203 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  61.76 
 
 
217 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  61.88 
 
 
205 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  59.6 
 
 
203 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  56.52 
 
 
205 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  58.29 
 
 
214 aa  234  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  56.25 
 
 
204 aa  234  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  55.78 
 
 
219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  56.81 
 
 
212 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  54.5 
 
 
207 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  54.5 
 
 
207 aa  228  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  56.52 
 
 
214 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  52.97 
 
 
208 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  52.43 
 
 
206 aa  224  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  52 
 
 
221 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  51 
 
 
204 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 
206 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 
206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 
206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  51.18 
 
 
207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  53.92 
 
 
211 aa  214  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  51.78 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  50.24 
 
 
207 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  50 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  51.53 
 
 
204 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  51.78 
 
 
207 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  48.53 
 
 
204 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  48.83 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  47.8 
 
 
207 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  51.74 
 
 
209 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  49.03 
 
 
200 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  51.46 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  45.37 
 
 
205 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  47.87 
 
 
206 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 
201 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  45.37 
 
 
212 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  42.13 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  34.3 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.29 
 
 
241 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  34.6 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  34.27 
 
 
246 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  32.23 
 
 
197 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  27.41 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>