51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5259 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  59.02 
 
 
206 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  55.67 
 
 
197 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  53.88 
 
 
212 aa  214  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  55.29 
 
 
217 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  55.66 
 
 
203 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  49.76 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  51.18 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  52.61 
 
 
206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  52.61 
 
 
206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  52.61 
 
 
206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  53.46 
 
 
204 aa  197  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  57.71 
 
 
214 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  53.96 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  53.37 
 
 
204 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  52.43 
 
 
207 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  51.74 
 
 
206 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  50.7 
 
 
206 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  50.7 
 
 
206 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  50.25 
 
 
207 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  52.86 
 
 
205 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  50.97 
 
 
203 aa  188  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  52.17 
 
 
203 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  48.53 
 
 
221 aa  187  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  47.66 
 
 
204 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  55.98 
 
 
211 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  50.24 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  47.6 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  48.33 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  50.96 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  43.33 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  47.15 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  45.5 
 
 
208 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  50.51 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  45.96 
 
 
207 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  43.89 
 
 
216 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  47.24 
 
 
200 aa  161  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
201 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  45.12 
 
 
212 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  45.89 
 
 
206 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.84 
 
 
244 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  37.21 
 
 
241 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  39.44 
 
 
243 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  39.63 
 
 
246 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  34.47 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.39 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>