51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4105 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  68.62 
 
 		 244 aa  324  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  62.98 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  40.57 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  39.42 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  40.48 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  36.45 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  39.81 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  39.9 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  38.79 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  39.82 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  37.07 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  37.56 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  34.09 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  37.21 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  34.27 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  38.42 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  34.91 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  34.74 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  34.76 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  34.29 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  32.2 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  35.58 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  33.18 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  33.65 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  35.07 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  31.9 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.39 
 
 		 202 aa  88.6  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.81 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  28.04 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>