51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2629 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  73.13 
 
 
204 aa  310  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  69.08 
 
 
205 aa  298  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  65.7 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  65.35 
 
 
203 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  64.47 
 
 
204 aa  274  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  62.38 
 
 
204 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  60.7 
 
 
203 aa  254  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  61.22 
 
 
207 aa  251  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  61.03 
 
 
221 aa  250  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  56.59 
 
 
207 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  59.5 
 
 
206 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  57.79 
 
 
206 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  59.5 
 
 
206 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  59.5 
 
 
206 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  56.07 
 
 
216 aa  240  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  58.5 
 
 
206 aa  238  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  57.14 
 
 
219 aa  237  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  58.29 
 
 
206 aa  234  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  58.21 
 
 
205 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  57.67 
 
 
207 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  57.44 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  60.51 
 
 
200 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  56.92 
 
 
203 aa  226  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  55.76 
 
 
212 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  54.25 
 
 
204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  54.46 
 
 
207 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  56.61 
 
 
204 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  55.28 
 
 
220 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  53.5 
 
 
207 aa  222  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  53.55 
 
 
214 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  57.14 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  54.5 
 
 
212 aa  207  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  51.28 
 
 
207 aa  204  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  51.79 
 
 
201 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  51.52 
 
 
205 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.31 
 
 
206 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  49.5 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  47.6 
 
 
209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  43.26 
 
 
244 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  42.86 
 
 
243 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  45.31 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  39.42 
 
 
241 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  42.51 
 
 
246 aa  138  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  32.99 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  29.84 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  32.11 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>