51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1829 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  72.14 
 
 
207 aa  307  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  73.47 
 
 
207 aa  304  6e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  70.15 
 
 
206 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  70.15 
 
 
206 aa  297  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  70.15 
 
 
206 aa  297  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  71.14 
 
 
206 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  70.65 
 
 
206 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  65.52 
 
 
207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  70.35 
 
 
200 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  63.86 
 
 
204 aa  271  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  60.89 
 
 
204 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  64.47 
 
 
220 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  59.52 
 
 
217 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  63.68 
 
 
203 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  58.25 
 
 
208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  60.28 
 
 
214 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  61.03 
 
 
214 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  57.35 
 
 
205 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  60.51 
 
 
204 aa  245  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  58.62 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  56.44 
 
 
203 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  56.63 
 
 
204 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  58.88 
 
 
204 aa  238  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  60.2 
 
 
201 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  53.77 
 
 
205 aa  235  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  52.83 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  56.72 
 
 
207 aa  231  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  56.5 
 
 
207 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  56.12 
 
 
203 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  52 
 
 
206 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  55.83 
 
 
211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  59.49 
 
 
212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  52.45 
 
 
212 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  53.14 
 
 
216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  49.76 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  48.53 
 
 
209 aa  187  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  51.55 
 
 
205 aa  187  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  48.72 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  39.72 
 
 
244 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  39.9 
 
 
243 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  38.79 
 
 
241 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  41.41 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  38.86 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
232 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  29.85 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  30.49 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.05 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>