52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2039 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  77 
 
 
207 aa  318  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  72.14 
 
 
206 aa  307  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  72.14 
 
 
206 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  72.14 
 
 
206 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  70.41 
 
 
207 aa  300  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  71.14 
 
 
206 aa  296  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  70.44 
 
 
206 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  70.35 
 
 
221 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  67.54 
 
 
207 aa  276  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  63.21 
 
 
204 aa  258  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  60.91 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  58.88 
 
 
204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  60 
 
 
204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  60.51 
 
 
214 aa  250  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  62.44 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  57.65 
 
 
204 aa  242  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  56.28 
 
 
205 aa  241  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  58.59 
 
 
203 aa  239  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  56.12 
 
 
217 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  58.5 
 
 
214 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  58.38 
 
 
207 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  54.87 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  55.07 
 
 
207 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  57.65 
 
 
201 aa  227  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  55.61 
 
 
205 aa  227  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  53.61 
 
 
203 aa  226  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  55.84 
 
 
204 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  52.17 
 
 
207 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  52.45 
 
 
212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  52.55 
 
 
203 aa  214  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  49.03 
 
 
206 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  51.21 
 
 
216 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  53.33 
 
 
211 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  56.06 
 
 
212 aa  204  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  52.06 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  49.75 
 
 
206 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  47.47 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  44.1 
 
 
206 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.38 
 
 
244 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  36.11 
 
 
241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  38.16 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  35.24 
 
 
246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  31.77 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  30.91 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>