51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3524 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  82.27 
 
 		 205 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  73.13 
 
 		 214 aa  310  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  71.56 
 
 		 217 aa  301  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  68.97 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  70.26 
 
 		 204 aa  284  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  64.71 
 
 		 204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  64.8 
 
 		 219 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  63.29 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  63.86 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  63.86 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  63.86 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  64.53 
 
 		 203 aa  260  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  60.59 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  62.81 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  62.87 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  60.7 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  60.85 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  60.61 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  60.51 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  60.71 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  61.65 
 
 		 212 aa  240  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  61.88 
 
 		 203 aa  239  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  60.2 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  59.11 
 
 		 220 aa  236  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  58.91 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  65.82 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  56.25 
 
 		 206 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  60 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  60.75 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  53.96 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  53.66 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  54.36 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  53.69 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  49.24 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  52 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  53.37 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  47.14 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  42.53 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  45.41 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  40.74 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  39.9 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  39.61 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  35.53 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  33.14 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.96 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>