51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  61.86 
 
 
205 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  61.43 
 
 
204 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  61.4 
 
 
203 aa  254  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  60.85 
 
 
204 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  58.94 
 
 
217 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  56.07 
 
 
214 aa  240  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  54.81 
 
 
207 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  54.25 
 
 
206 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  54.25 
 
 
206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  54.25 
 
 
206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  53.24 
 
 
204 aa  214  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  54.38 
 
 
206 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  53.14 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  53.02 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  50 
 
 
205 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  53.27 
 
 
212 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  51.42 
 
 
207 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  52.53 
 
 
206 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  50.24 
 
 
207 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  50.69 
 
 
207 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  52.09 
 
 
219 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  50.23 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  50.45 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  48.83 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  50.49 
 
 
204 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  51.9 
 
 
204 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  53.4 
 
 
211 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  50.72 
 
 
203 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  51.18 
 
 
214 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  50.72 
 
 
200 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  47.89 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  45.37 
 
 
208 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  49.29 
 
 
212 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  49.53 
 
 
205 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 
201 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  48.53 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  44.24 
 
 
206 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  43.89 
 
 
209 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  36.94 
 
 
244 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  35.84 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.09 
 
 
241 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  37.62 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  35.56 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  33.17 
 
 
202 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.69 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  29.71 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>