51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3938 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  493  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  63.45 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  64.17 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  61.38 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  40.93 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  39.53 
 
 		 204 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  43 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 217 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  39.17 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  39.61 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  36.45 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  36.7 
 
 		 205 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  37.9 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  37.67 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  36.02 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  34.74 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  39.63 
 
 		 209 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  36.24 
 
 		 206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  38.39 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  36.15 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  36.74 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  39.52 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  35.41 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  34.27 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  35.56 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  37.91 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  34.91 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  35.85 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  32.04 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  36.32 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  33.65 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  37.07 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  34.42 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  36.89 
 
 		 206 aa  95.5  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  31 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  33.49 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  30.39 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>