51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3516 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  88.89 
 
 		 207 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  70 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  65.02 
 
 		 219 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  61.95 
 
 		 217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  62.25 
 
 		 203 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  62.32 
 
 		 204 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  61.06 
 
 		 203 aa  245  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  60.4 
 
 		 207 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  57.35 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  57.35 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  58.88 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  56.87 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  64.56 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  57.35 
 
 		 206 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  57.35 
 
 		 206 aa  237  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  60.82 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  58.91 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  54.76 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  55.83 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  57.92 
 
 		 205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  56.72 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  54.5 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  61.08 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  56.22 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  53.5 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  53.14 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  53.47 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  51.78 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  53.27 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  52.17 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  51 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  50.98 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  50.23 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  51.44 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  52.43 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  46.6 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  51.5 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  48.74 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  45.88 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  38.03 
 
 		 244 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  36.14 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.91 
 
 		 241 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  36.15 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  35.5 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  30.05 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>