51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1829 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
201 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  62.12 
 
 
207 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  58.62 
 
 
206 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  58.62 
 
 
206 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  58.62 
 
 
206 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  60.2 
 
 
221 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  57.64 
 
 
206 aa  234  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  57.21 
 
 
207 aa  234  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  59.7 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  58.38 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  57.64 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  56 
 
 
207 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  51.96 
 
 
204 aa  214  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  52.28 
 
 
204 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  52.85 
 
 
220 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  51.5 
 
 
217 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  51.79 
 
 
203 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  51.79 
 
 
214 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  57.65 
 
 
200 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  52.76 
 
 
208 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  52.24 
 
 
203 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  50.98 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  50.25 
 
 
205 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  55.79 
 
 
212 aa  198  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  49 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  49.24 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  49.74 
 
 
219 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  48.53 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  51.72 
 
 
214 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  49.5 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  47.89 
 
 
203 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  48.22 
 
 
206 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  45.5 
 
 
216 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  44.71 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  49.75 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  48.21 
 
 
211 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  43.63 
 
 
206 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  44.5 
 
 
206 aa  158  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  42.21 
 
 
209 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  36.95 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  36.28 
 
 
244 aa  124  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  37.02 
 
 
241 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  36.98 
 
 
197 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  35.07 
 
 
246 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  34 
 
 
202 aa  104  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  35.15 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  28.74 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>