51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1547 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1547  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3603  DSBA oxidoreductase  65.85 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3676  DSBA oxidoreductase  65.85 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3608  DSBA oxidoreductase  65.85 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2578  DsbA oxidoreductase  66.01 
 
 		 206 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4056  DsbA oxidoreductase  63.55 
 
 		 206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1143  hypothetical protein  65.84 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1399  DSBA oxidoreductase  64.25 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1829  hypothetical protein  64.47 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.055249  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12491  hypothetical protein  62.14 
 
 		 207 aa  265  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3394  hypothetical protein  61.46 
 
 		 207 aa  254  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7335  DSBA oxidoreductase  60 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134814  hitchhiker  0.00000558236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1372  DSBA oxidoreductase  59.9 
 
 		 204 aa  244  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.989874  hitchhiker  0.00124828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11880  DSBA-like thioredoxin  56.46 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3524  hypothetical protein  59.11 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2039  DSBA oxidoreductase  60.91 
 
 		 200 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24570  hypothetical protein  57.5 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5304  hypothetical protein  56.46 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.763767  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1350  hypothetical protein  54.95 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2629  hypothetical protein  55.28 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3516  hypothetical protein  56.22 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3891  hypothetical protein  56 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2203  hypothetical protein  57.14 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2402  hypothetical protein  53.5 
 
 		 204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0589565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2156  hypothetical protein  55.98 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000179872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5291  hypothetical protein  57.62 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1383  DsbA oxidoreductase  52.76 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0970457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0944  hypothetical protein  53.03 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7324  hypothetical protein  51.78 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1829  DSBA oxidoreductase  52.85 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.797424  normal  0.329034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09030  hypothetical protein  50.45 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2344  hypothetical protein  49.51 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.638445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09910  DSBA-like thioredoxin  47.85 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3412  hypothetical protein  51.42 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0229  hypothetical protein  52.31 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2192  hypothetical protein  50.52 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5259  hypothetical protein  50.51 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103171  normal  0.0778828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4049  hypothetical protein  46.83 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11650  hypothetical protein  45.1 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4105  hypothetical protein  34.84 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2082  hypothetical protein  37.26 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4895  hypothetical protein  36.99 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1801  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.445445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3938  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0420464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0835  hypothetical protein  29.15 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.658425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1501  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1479  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1476  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  28.21 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1123  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>