8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1507 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1507  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0754  DSBA oxidoreductase  50.25 
 
 
199 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12308  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 
216 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  37.88 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
255 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>