More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0249 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  82.24 
 
 
535 aa  747    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  100 
 
 
535 aa  1012    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  79.17 
 
 
535 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  55.53 
 
 
535 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  58.27 
 
 
540 aa  508  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  52.9 
 
 
539 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  52.19 
 
 
538 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  50.93 
 
 
533 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  51.85 
 
 
553 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  50.37 
 
 
533 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  53.9 
 
 
534 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  52.69 
 
 
540 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  46.8 
 
 
535 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  46.62 
 
 
535 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  41.11 
 
 
527 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  41.97 
 
 
527 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  41.53 
 
 
527 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  41.18 
 
 
526 aa  359  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29 
 
 
523 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
515 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.14 
 
 
526 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.45 
 
 
516 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 
524 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
613 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.79 
 
 
515 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.67 
 
 
534 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 
530 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.5 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 
530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  30.29 
 
 
533 aa  147  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 
522 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.8 
 
 
521 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 
518 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  32.91 
 
 
517 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.53 
 
 
539 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  31.46 
 
 
528 aa  143  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.26 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  28.8 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  31.85 
 
 
524 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.12 
 
 
534 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  29.01 
 
 
521 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 
521 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 
522 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
526 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
523 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  30.73 
 
 
511 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
522 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 
519 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 
511 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.94 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  31.5 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.33 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.95 
 
 
523 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 
519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  30.43 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.21 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.63 
 
 
525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.74 
 
 
529 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  26.78 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.63 
 
 
523 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
512 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
520 aa  127  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 
511 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 
519 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 
519 aa  127  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27.42 
 
 
523 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 
555 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
519 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 
519 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 
495 aa  126  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 
517 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.26 
 
 
498 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  30 
 
 
513 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 
545 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  26.54 
 
 
511 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 
521 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  29.92 
 
 
521 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>