More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0263 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  88.8 
 
 
527 aa  895    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  70.31 
 
 
526 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  100 
 
 
527 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  88.24 
 
 
527 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  41.11 
 
 
535 aa  359  8e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  40.26 
 
 
535 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  45.55 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  40.87 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  45.62 
 
 
535 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  47.22 
 
 
535 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  38.76 
 
 
540 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  38.54 
 
 
538 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  35.32 
 
 
553 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 
539 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 
540 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  36.17 
 
 
534 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  24.52 
 
 
529 aa  130  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  24.52 
 
 
555 aa  127  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  24.74 
 
 
529 aa  127  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  25.45 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 
531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
531 aa  114  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.63 
 
 
522 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  24.56 
 
 
534 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  25.91 
 
 
525 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25 
 
 
511 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.53 
 
 
521 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25 
 
 
511 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
535 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  24.89 
 
 
511 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.33 
 
 
613 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
556 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 
524 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  26.21 
 
 
521 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  24.29 
 
 
511 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  23.84 
 
 
526 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 
529 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.64 
 
 
511 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 
534 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  22.7 
 
 
539 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  24.75 
 
 
530 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  25.66 
 
 
525 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  23.49 
 
 
522 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  26.24 
 
 
517 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  23.93 
 
 
517 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  24.11 
 
 
515 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
533 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  22.05 
 
 
518 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  23.26 
 
 
517 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
530 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  24.8 
 
 
519 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  22.65 
 
 
512 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  25 
 
 
528 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  25 
 
 
519 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  25 
 
 
519 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  25 
 
 
519 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  24.79 
 
 
519 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0625  virulence factor MVIN family protein  23.06 
 
 
448 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289297  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.23 
 
 
519 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  23.77 
 
 
545 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  24.84 
 
 
519 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 
517 aa  100  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  23.89 
 
 
509 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  23.68 
 
 
521 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  23.84 
 
 
508 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.09 
 
 
511 aa  100  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  25.3 
 
 
519 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.73 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.73 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
542 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  23.75 
 
 
520 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  23.51 
 
 
512 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 
523 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
512 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  24.74 
 
 
512 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  24.28 
 
 
498 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
519 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  23.39 
 
 
521 aa  99  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  23.51 
 
 
512 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  25.16 
 
 
513 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 
519 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
519 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>