More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0278 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  100 
 
 
535 aa  1020    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  82.24 
 
 
535 aa  789    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  77.38 
 
 
535 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  58.14 
 
 
540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  53.46 
 
 
535 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  53.72 
 
 
538 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  51.39 
 
 
539 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  53.43 
 
 
533 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  53.77 
 
 
533 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  51.25 
 
 
553 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  52.77 
 
 
534 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  50.56 
 
 
540 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  50.98 
 
 
535 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  51.57 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 
527 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  40.48 
 
 
527 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  41.36 
 
 
527 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  40.67 
 
 
526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 
515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.35 
 
 
515 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.48 
 
 
613 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.47 
 
 
521 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 
524 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  34 
 
 
511 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  30.57 
 
 
516 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  33.16 
 
 
517 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 
529 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 
530 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 
521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.76 
 
 
534 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 
521 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.26 
 
 
517 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
534 aa  150  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 
522 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.01 
 
 
539 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.56 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  31.48 
 
 
518 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  31.02 
 
 
524 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.81 
 
 
523 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 
521 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.83 
 
 
528 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
521 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  31.8 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
521 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.99 
 
 
573 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  32.26 
 
 
521 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 
545 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.56 
 
 
505 aa  140  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 
520 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 
511 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.31 
 
 
530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 
517 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 
517 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  23.99 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  29.96 
 
 
512 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  30.33 
 
 
556 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
514 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 
519 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
519 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
519 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 
519 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 
526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 
524 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.5 
 
 
521 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 
517 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.55 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
541 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
511 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.99 
 
 
525 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  29.5 
 
 
513 aa  130  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 
521 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 
494 aa  130  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 
532 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 
514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  31.31 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.5 
 
 
511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.98 
 
 
529 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.05 
 
 
523 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
536 aa  128  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
519 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  27.9 
 
 
519 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 
517 aa  127  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
498 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>